物語の舞台は、ウルトラマンや怪獣が一度も現れたことのない地球。ある日、宇宙から偶然、一人の宇宙人が落下してきた。彼は自らの正体を象徴する赤い宇宙ブーメラン「オメガヘッドダーツ」を手に持ち、「アルティメット」と呼ばれていた。過去の記憶を失った宇宙人「オメガ」は地球人に変身し、「周仁」と名乗る。地球に降り立ったばかりの周仁は、人間への好奇心に溢れ、これらの奇妙な生命体と積極的に接触し、理解を深めていく。次々と謎の巨大生物が現れた時、塵にまみれた記憶の断片が目覚め、周仁はそれらの生物こそが自身の記憶の中の「怪獣」であることを悟る。怪獣の脅威に直面し、強い使命感に突き動かされた周仁は、ウルトラマンオメガに変身し、怪獣たちと戦う。一方、地球の人間たちは、突如現れた巨大生物と、それに対抗するために赤いヘッドダーツを構える巨人たちに、疑念を抱き始める。真実を探るため、人類はこの謎の巨人をあらゆる角度から観察し始めた。物語が進むにつれ、宇宙から来た周仁と平凡な青年は、次第に共に戦うパートナーへと成長していく。二人の絆と経験を通して、「なぜウルトラマンは地球を守るのか？」という問いへの答えを深く探究していく。今こそ、目覚めよ。